martes, 15 de septiembre de 2015

Ayuda para crear una base de datos de RNA ribosómico en gónadas de peces

Resultado de imagen de fish gonad

El grupo de investigación BCTA del Departamento de Zoología y Biología Celular de la Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea, solicita colaboración para crear una base de datos sobre: Perfiles de RNA ribosómico en gónadas de peces.

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Queridos colegas:              

Nos dirigimos a vosotros con la intención de recabar información y colaborar en la elaboración de una base de datos sobre: Perfiles de RNA ribosómico en gónadas de peces

En el grupo de investigación BCTA del Departamento de Zoología y Biología Celular de la Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea, llevamos varios años trabajando en el campo de la ecotoxicología utilizando varios modelos de peces. En estos últimos años hemos tratado de explicar la utilidad de una nueva metodología para el sexado de peces basada en el estudio electroforético de migración del RNA ribosómico obtenido mediante extracción de RNA total de gónada (Diaz de Cerio et al, 2012). El 5S rRNA es más abundante en hembras que en machos, por lo que una simple electroforesis nos ayuda a identificar el sexo sin necesidad de ningún proceso histológico. Podemos identificar el estadio reproductor de las hembras calculando un simple índice de 5S/18S rRNA que identifica hembras en previtelogénesis, alveolos corticales, vitelogénesis o en maduración. Además, el mismo análisis sirve para distinguir machos intersex (machos con ovocitos en testículo) por el hecho de que el 5S rRNA se expresa abundantemente en oocitos.

En nuestro laboratorio hemos contrastado la técnica en especies comerciales que abundan nuestra costa: merluza, lirio, gallo, lenguado, anchoa, sardina, jurel y caballa (entre otras). Para generalizar el uso de esta metodología a otras especies de peces, necesitamos probar que es útil con especies con diferentes estrategias y ciclos reproductivos. Además, carecemos de muestras de individuo intersex en especies que no sean Chelon labrosus.

Recientemente, en el “5th International Workshop on the Biology of Fish Gametes 2015”celebrado en Ancona (Italia), hemos hecho un llamamiento a la colaboración entre laboratorios para poder reunir archivos XDA con el perfil de rRNA de gónadas de diferentes especies. Estos archivos son los resultados de los análisis de calidad de RNA usando como instrumento el Bioanalyzer 2100 de Agilent.

Por todo ello, agradeceríamos profundamente si pudierais participar en nuestra iniciativa aportando dichos archivos y completando la información que requerimos.

En el siguiente link explicamos todo el proceso más detalladamente, y podréis bajar información adicional, así como un video explicativo.


Todo el proceso no debería de llevaros más de 20 minutos.

Cómo agradecimiento a vuestra ayuda y con los posibles resultados obtenidos esperamos poder escribir un artículo científico en el cual un miembro de cada grupo de investigación sería invitado a participar.

Si tenéis alguna duda al respecto, no dudéis en contactar con nosotros, mediante el siguiente contacto  fishoorna@gmail.com o simplemente dejando una pregunta en el link que os hemos proporcionado.

Atentamente,

El grupo de Investigación BCTA

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