Ayuda para crear una base de datos de RNA ribosómico en gónadas de peces

El grupo de investigación BCTA del Departamento de Zoología y Biología Celular de la Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea, solicita colaboración para crear una base de datos sobre: Perfiles de RNA ribosómico en gónadas de peces.

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Queridos colegas:              

Nos dirigimos a vosotros con la intención de recabar información y colaborar en la elaboración de una base de datos sobre: Perfiles de RNA ribosómico en gónadas de peces

En el grupo de investigación BCTA del Departamento de Zoología y Biología Celular de la Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea, llevamos varios años trabajando en el campo de la ecotoxicología utilizando varios modelos de peces. En estos últimos años hemos tratado de explicar la utilidad de una nueva metodología para el sexado de peces basada en el estudio electroforético de migración del RNA ribosómico obtenido mediante extracción de RNA total de gónada (Diaz de Cerio et al, 2012). El 5S rRNA es más abundante en hembras que en machos, por lo que una simple electroforesis nos ayuda a identificar el sexo sin necesidad de ningún proceso histológico. Podemos identificar el estadio reproductor de las hembras calculando un simple índice de 5S/18S rRNA que identifica hembras en previtelogénesis, alveolos corticales, vitelogénesis o en maduración. Además, el mismo análisis sirve para distinguir machos intersex (machos con ovocitos en testículo) por el hecho de que el 5S rRNA se expresa abundantemente en oocitos.

En nuestro laboratorio hemos contrastado la técnica en especies comerciales que abundan nuestra costa: merluza, lirio, gallo, lenguado, anchoa, sardina, jurel y caballa (entre otras). Para generalizar el uso de esta metodología a otras especies de peces, necesitamos probar que es útil con especies con diferentes estrategias y ciclos reproductivos. Además, carecemos de muestras de individuo intersex en especies que no sean Chelon labrosus.

Recientemente, en el “5th International Workshop on the Biology of Fish Gametes 2015”celebrado en Ancona (Italia), hemos hecho un llamamiento a la colaboración entre laboratorios para poder reunir archivos XDA con el perfil de rRNA de gónadas de diferentes especies. Estos archivos son los resultados de los análisis de calidad de RNA usando como instrumento el Bioanalyzer 2100 de Agilent.

Por todo ello, agradeceríamos profundamente si pudierais participar en nuestra iniciativa aportando dichos archivos y completando la información que requerimos.

En el siguiente link explicamos todo el proceso más detalladamente, y podréis bajar información adicional, así como un video explicativo.

https://www.researchgate.net/post/Does_anyone_want_to_participate_in_a_Collaborative_Network_about_Profiling_of_Fish_Gonadal_Ribosomal_RNA

Todo el proceso no debería de llevaros más de 20 minutos.

Cómo agradecimiento a vuestra ayuda y con los posibles resultados obtenidos esperamos poder escribir un artículo científico en el cual un miembro de cada grupo de investigación sería invitado a participar.

Si tenéis alguna duda al respecto, no dudéis en contactar con nosotros, mediante el siguiente contacto  fishoorna@gmail.com o simplemente dejando una pregunta en el link que os hemos proporcionado.

Atentamente,

El grupo de Investigación BCTA

IMPRESS Genomics and Bioinformatics Workshop

A finales del próximo mes de Octubre tendrá lugar el IMPRESS Genomics and Bioinformatics Workshop, en Leiden (Holanda). Está fundamentalmente dirigido a becarios de la International Training Network IMPRESS, del programa Marie S. Curie y a otros investigadores interesados en profundizar en el campo de la genómica y bioinformática.

El programa consta de 4 días de clases teóricas sobre conceptos básicos y prácticas para el procesado de datos de secuenciación Nextgen.

La fecha límite para inscribirse es el 1 de octubre de 2015. Hay 15 plazas disponibles para investigadores no asociados al programa, que serán seleccionados por orden de fecha de inscripción.

Para más información: http://www.dtls.nl/courses/impress-genomics-and-bioinformatics-workshop-2015/

Mamen Vílchez gana el 2º premio de posters del 5th IWBFG

Nuestra compañera Mamen ha conseguido el segundo premio de posters presentados por estudiantes en el 5th International Workshop on the Biology of Fish Gametes por el trabajo titulado:

Identification of major proteins from the seminal plasma of hormone-induced sexual matured European eels (Anguilla anguilla). Correlation with sperm quality

que hemos realizado en colaboración con el Instituto de Biomedicina (CSIC) de Valencia, y que tiene como coautores a M.C. Vílchez, D. Pla, V. Gallego, L. Sanz, L. Pérez, J.F. Asturiano, J.J. Calvete, D.S. Peñaranda

Asistimos al 5th IWBFG

Entre el 6 y el 11 de septiembre parte del equipo hemos acudido al 5th International Workshop on the Biology of Fish Gametes (http://fishgametes2015.com/), que ha tenido lugar en la Università Politecnica delle Marche (Ancona, Italia), organizado por el equipo de nuestra colega la Dra. Oliana Carnevali.

En la foto podéis vernos acompañados de nuestros colegas, el Dr. Finn-Arne Weltzien (Noruega) y el Dr. Ignacio Giménez de la empresa Rara Avis Biotec S.L.

La Acción COST AQUAGAMETE ha cofinanciado una nueva edición de este congreso en el que hemos participado 140 científicos de 28 países, superando una vez más las ediciones anteriores. La 6ª edición se celebrará en Vodnany (República Checa) en 2017, coincidiendo con los 10 años de la primera edición que se celebró allí organizada por el equipo del Dr. Otomar Linhart.

Los trabajos que hemos presentado en este Workshop han sido:

    Como presentaciones orales:

● Progress, challenges and perspectives on fish gamete cryopreservation

J.F. Asturiano, Á. Horváth, E. Cabrita

(State-of-the-art de la sesión de criopreservación)

● First full spermatogenesis and spermiation induced with specific recombinant gonadotropins in a teleost fish, the European eel

D.S. Peñaranda, V. Gallego, R. Caccia, M.C. Vílchez, L. Pérez, A. Gómez, I. Giménez, J.F. Asturiano

● Ribogenesis molecular markers of oocyte differentiation in European eel Anguilla anguilla: transcriptional regulation during artificially induced oogenesis

I. Rojo-Bartolomé, L. Martínez-Miguel, A.G. Lafont, D.S. Peñaranda, M.C. Vílchez, J.F. Asturiano, L. Pérez, I. Cancio

● The role of ion sodium in the European eel sperm motility

M.C. Vílchez, M. Morini, D.S. Peñaranda, V. Gallego, J.F. Asturiano, L. Pérez

● Vitrification of fish sperm

E. Kása, G. Bernáth, T. Kollár, D. Żarski, J. Lujic, Z. Marinovic, Z. Bokor,  Á. Hegyi, B. Urbanyi, M.C. Vílchez, M. Morini, D.S. Peñaranda, L. Pérez, J.F. Asturiano, Á. Horváth

Como posters:

  

● The role of ion potassium and pH in the European eel sperm motility

M.C. Vílchez, M. Morini, D.S. Peñaranda, V. Gallego, J.F. Asturiano, L. Pérez

● Effect of ions Ca²⁺, K⁺ and Na⁺ on sperm motility of European eel and Senegalese sole 

M.C. Vílchez, M.F. Riesco, J.F. Asturiano, E. Cabrita, L. Pérez

● Cryopreservation of zebrafish sperm, first trials and results

J.F. Asturiano, M.F. Riesco, G. Martins, M.C. Vílchez, L. Pérez, P. Gavaia, E. Cabrita

● Identification of major proteins from the seminal plasma of hormone-induced sexual matured European eels (Anguilla anguilla). Correlation with sperm quality

M.C. Vílchez, D. Pla, V. Gallego, L. Sanz, L. Pérez, J.F. Asturiano, J.J. Calvete, D.S. Peñaranda

● Effect of extenders on Senegalese sole (Solea senegalensis) sperm
L. Pérez, M.F. Riesco, M.C. Vílchez, J.F. Asturiano, E. Cabrita